Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
SacsQ9JLC8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
SacsQ9JLC8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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SacsQ9JLC8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SacsQ9JLC8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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