Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gde1Q9JL56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gde1Q9JL56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gde1Q9JL56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms