Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cnot9Q9JKY0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnot9Q9JKY0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms