Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Habp4Q9JKS5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Habp4Q9JKS5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms