Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nova1Q9JKN6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nova1Q9JKN6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms