Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AtrQ9JKK8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtrQ9JKK8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms