Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trem1Q9JKE2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trem1Q9JKE2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms