Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tuba8Q9JJZ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tuba8Q9JJZ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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