Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpd3Q9JJY3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smpd3Q9JJY3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms