Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Alyref2Q9JJW6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alyref2Q9JJW6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms