Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Riox1Q9JJF3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Riox1Q9JJF3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms