Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacna1fQ9JIS7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1fQ9JIS7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1fQ9JIS7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172 ms