Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmod3Q9JHJ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmod3Q9JHJ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms