Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Cxcl11Q9JHH5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Cxcl11Q9JHH5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Cxcl11Q9JHH5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Cxcl11Q9JHH5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Cxcl11Q9JHH5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl11Q9JHH5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Cxcl11Q9JHH5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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Cxcl11Q9JHH5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Cxcl11Q9JHH5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl11Q9JHH5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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