Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf13bQ9ET35 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms