Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hapln2Q9ESM3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms