Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LrbaQ9ESE1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LrbaQ9ESE1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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