Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp29Q9ES63 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Usp29Q9ES63 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp29Q9ES63 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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