Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trhr2Q9ERT2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trhr2Q9ERT2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms