Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ripk4Q9ERK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ripk4Q9ERK0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ripk4Q9ERK0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms