Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scn4aQ9ER60 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scn4aQ9ER60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4aQ9ER60 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms