Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn12Q9ER56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn12Q9ER56 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms