Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf21Q9EPU5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf21Q9EPU5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms