Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cpsf1Q9EPU4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cpsf1Q9EPU4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpsf1Q9EPU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms