Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl4Q9DCU6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrpl4Q9DCU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrpl4Q9DCU6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrpl4Q9DCU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms