Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufa8Q9DCJ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms