Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GabarapQ9DCD6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabarapQ9DCD6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms