Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnpy3Q9DAU1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnpy3Q9DAU1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnpy3Q9DAU1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms