Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smco2Q9DA21 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smco2Q9DA21 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms