Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actrt1Q9D9J3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actrt1Q9D9J3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms