Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9D9H8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9H8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9H8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9D9H8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms