Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldnd2Q9D9H2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd2Q9D9H2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms