Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc70Q9D9B0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc70Q9D9B0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc70Q9D9B0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc70Q9D9B0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc70Q9D9B0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc70Q9D9B0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms