Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2e2Q9D902 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e2Q9D902 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms