Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SlirpQ9D8T7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SlirpQ9D8T7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms