Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rpl4Q9D8E6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl4Q9D8E6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms