Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4bQ9D8B3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4bQ9D8B3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4bQ9D8B3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms