Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgm5Q9D7I9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgm5Q9D7I9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms