Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chmp4cQ9D7F7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chmp4cQ9D7F7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chmp4cQ9D7F7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms