Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn23Q9D7D7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn23Q9D7D7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms