Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Srp19Q9D7A6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Srp19Q9D7A6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Srp19Q9D7A6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Srp19Q9D7A6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp19Q9D7A6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Srp19Q9D7A6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp19Q9D7A6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp19Q9D7A6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp19Q9D7A6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp19Q9D7A6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srp19Q9D7A6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srp19Q9D7A6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp19Q9D7A6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp19Q9D7A6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp19Q9D7A6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp19Q9D7A6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp19Q9D7A6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp19Q9D7A6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srp19Q9D7A6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms