Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf13Q9D777 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms