Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap5s1Q9D742 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap5s1Q9D742 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms