Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ca13Q9D6N1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ca13Q9D6N1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms