Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc39Q9D5Y1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms