Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc83Q9D4V3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms