Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul2Q9D4H8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms