Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag1Q9D3E6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Stag1Q9D3E6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag1Q9D3E6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms