Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700034E13RikQ9D2T6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms