Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pramef12Q9D2F1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pramef12Q9D2F1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pramef12Q9D2F1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms